På den smukke ø Tropico regner det aldrig; El Presidente insisterer på det. Så når skyerne trækker ind, og regnen begynder at falde, ved du, at noget er på vej. Rygterne siger, at en gruppe borgere har samlet sig for at danne en mystisk kult og har lagt en forbandelse over Tropico. En ny overnaturlig autoritet er på udkig efter at overtage magten, og du, som El Presidente, har brug for guddommelig hjælp til at løfte forbandelsen. Ind træder inkvisitionen. Bring de særlige tjenester, som inkvisitionen tilbyder, til Tropico og hold dem i godt humør ved at bygge dem et nyt hovedkvarter, hvorfra de kan nedkæmpe kultisterne og deres overnaturlige forbrydelser. Men lad dem ikke få for meget magt. Sørg for at minde dem om, at kun du, El Presidente, er den eneste sande hersker over Tropico. Kun gennem din omhyggelige ledelse kan du sikre, at Tropico vender tilbage til den ø-paradis, det engang var.