Di pulau Tropico yang indah, hujan tak pernah turun; El Presidente menegaskannya. Jadi, ketika awan mulai berkumpul dan hujan mulai turun, kamu tahu ada sesuatu yang akan terjadi. Kabar burung mengatakan bahwa sekelompok warga telah bersatu membentuk sebuah kultus misterius dan telah mengutuk Tropico. Sebuah otoritas supernatural baru sedang berusaha merebut kekuasaan dan kamu, sebagai El Presidente, memerlukan bantuan ilahi untuk mengangkat kutukan tersebut. Masuklah, Inkuisisi. Bawa layanan khusus yang disediakan oleh Inkuisisi ke Tropico dan jaga agar mereka tetap berpihak padamu dengan membangun markas baru untuk menjatuhkan para kultus dan kesalahan supernatural mereka. Tapi jangan biarkan mereka memiliki terlalu banyak kekuasaan. Pastikan kamu mengingatkan mereka bahwa hanya kamu, El Presidente, yang merupakan penguasa sejati Tropico. Hanya melalui manajemenmu yang hati-hati, kamu bisa menjamin bahwa Tropico kembali menjadi pulau surga seperti sebelumnya.