아름다운 트로피코 섬에서는 비가 내리지 않습니다. 엘 프레시덴테가 그렇게 하기로 했기 때문이죠. 그런데 구름이 끼고 비가 내리기 시작하면 뭔가 일이 벌어질 조짐입니다. 소문에 따르면, 시민들이 뭉쳐 신비로운 컬트를 형성하고 트로피코에 저주를 내렸다고 합니다. 새로운 초자연적 권력이 권력을 잡으려 하고 있으며, 당신은 엘 프레시덴테로서 이 저주를 풀기 위해 신의 도움이 필요합니다. 그러니, 인퀴지션이 등장합니다. 인퀴지션이 제공하는 특별 서비스를 트로피코에 도입하고, 그들이 컬트와 그들의 초자연적 악행을 처치할 수 있도록 새로운 본부를 건설해 그들의 호의를 얻으세요. 하지만 그들에게 너무 많은 권력을 주지 마세요. 오직 당신, 엘 프레시덴테만이 트로피코의 진정한 통치자임을 잊지 않도록 상기시켜야 합니다. 당신의 세심한 관리만이 트로피코를 예전의 섬의 낙원으로 되돌릴 수 있습니다.