På den vakre øya Tropico regner det aldri; El Presidente insisterer på det. Så når skyene ruller inn og regnet begynner å falle, vet du at noe er på vei. Ryktene sier at en gruppe borgere har samlet seg for å danne en mystisk kult og har lagt en forbannelse over Tropico. En ny overnaturlig autoritet er ute etter å ta makten, og du, som El Presidente, trenger guddommelig hjelp for å løfte forbannelsen. Her kommer inkvisisjonen inn. Bring de spesielle tjenestene fra inkvisisjonen til Tropico og hold dem i godt humør ved å bygge dem et nytt hovedkvarter hvor de kan bekjempe kultistene og deres overnaturlige ugjerninger. Men ikke la dem få for mye makt. Husk å minne dem på at det kun er du, El Presidente, som er den ene sanne herskeren av Tropico. Bare gjennom din nøye ledelse kan du sikre at Tropico vender tilbake til den øyparadiset det en gang var.